Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms