Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spocd1B1ASB6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms