Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp36B1AQJ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms