Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem238A9JSM3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem238A9JSM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem238A9JSM3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem238A9JSM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem238A9JSM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem238A9JSM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms