Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3173A6NAS3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms