Protein–RNA interactions for Protein: A6H603

Nwd1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd1A6H603 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nwd1A6H603 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nwd1A6H603 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd1A6H603 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd1A6H603 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms