Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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