Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Odf2A3KGV1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms