Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc9bA3KGF9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms