Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8b5A3FIN4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms