Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatsperbA2RTF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms