Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Htra4A2RT60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms