Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms