Protein–RNA interactions for Protein: A2BHN9

4931422A03Rik, RIKEN cDNA 4931422A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931422A03RikA2BHN9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931422A03RikA2BHN9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
4931422A03RikA2BHN9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931422A03RikA2BHN9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms