Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl41A2AUC9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms