Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Upf2A2AT37 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms