Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn3aA2ASI5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms