Protein–RNA interactions for Protein: A2APZ1

1700001O22Rik, RIKEN cDNA 1700001O22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001O22RikA2APZ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700001O22RikA2APZ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700001O22RikA2APZ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700001O22RikA2APZ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms