Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll9A2APC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms