Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syndig1A2ANU3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms