Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms