Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc183A2AJB1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc183A2AJB1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms