Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel3A2AHA7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel3A2AHA7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms