Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Myom3A2ABU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myom3A2ABU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myom3A2ABU4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myom3A2ABU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myom3A2ABU4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Myom3A2ABU4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myom3A2ABU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myom3A2ABU4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myom3A2ABU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms