Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700023F06RikA2AB62 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms