Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szt2A2A9C3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Szt2A2A9C3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szt2A2A9C3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms