Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87977A2A958 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C87977A2A958 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms