Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm16A2A935 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms