Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd5A2A8L1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd5A2A8L1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms