Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb4A2A863 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms