Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc112A0AUP1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc112A0AUP1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms