Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AU041133A0A0J9YVH3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU041133A0A0J9YVH3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms