Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms