Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms