Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv31A0A075B5J5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms