Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sema6cQ9WTM3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sema6cQ9WTM3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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