Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms