Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chmp2aQ9DB34 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chmp2aQ9DB34 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms