Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Derl3Q9D8K3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms