Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms