Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zbed3Q9D0L1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms