Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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