Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms