Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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