Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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