Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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