Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms