Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms