Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttbk1Q6PCN3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttbk1Q6PCN3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms