Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PcolceQ61398 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms